Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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