Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZDHHC3Q9NYG2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms