Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms