Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms