Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SAMSN1Q9NSI8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms