Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms