Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms