Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms