Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms