Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ARHGEF3Q9NR81 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms