Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms