Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms