Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms