Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRMS1Q9HCU9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRMS1Q9HCU9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRMS1Q9HCU9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRMS1Q9HCU9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRMS1Q9HCU9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRMS1Q9HCU9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRMS1Q9HCU9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRMS1Q9HCU9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRMS1Q9HCU9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRMS1Q9HCU9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRMS1Q9HCU9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRMS1Q9HCU9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRMS1Q9HCU9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRMS1Q9HCU9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRMS1Q9HCU9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRMS1Q9HCU9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms