Protein–RNA interactions for Protein: Q9H788

SH2D4A, SH2 domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4AQ9H788 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D4AQ9H788 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D4AQ9H788 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms