Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J1

ARRDC1-AS1, Uncharacterized protein ARRDC1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-AS1Q9H2J1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARRDC1-AS1Q9H2J1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms