Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6AQ9H2E6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms