Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms