Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms