Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms