Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SENP6Q9GZR1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms