Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms