Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms