Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS2Q9BXC9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms