Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms