Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms