Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAGR1Q9BTK6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms