Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE5

AGMAT, Agmatinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGMATQ9BSE5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AGMATQ9BSE5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGMATQ9BSE5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms