Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLF1Q9BQI6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms