Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms