Protein–RNA interactions for Protein: Q99758

ABCA3, ATP-binding cassette sub-family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA3Q99758 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCA3Q99758 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCA3Q99758 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms