Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms