Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms