Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms