Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms