Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
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