Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms