Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms