Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
COG3Q96JB2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms