Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms