Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms