Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms