Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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