Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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TRIM63Q969Q1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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