Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms