Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms