Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms