Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms