Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHDC4Q8TBB5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms