Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms